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Title：A Targeted Multi-omic Analysis Approach Measures Protein Expression and Low-Abundance Transcripts on the Single-Cell Level

发表期刊：Cell Rep

发表时间：2020年

研究单位：Vaccine and Infectious Disease Division，BD Biosciences, Public Health Sciences Division，University of Washington

IF: 8.109

2020年单细胞测序研究：BD单细胞靶向转录组测序与表面蛋白检测技术联合应用提升单细胞转录本检测效能

研究背景： 高通量单细胞RNA测序（scRNA-seq）已成为评估免疫细胞异质性的常用工具。 目前，已开发出结合RNA和蛋白质表达的测量方法，比如CITE-seq（cellular indexing of transcriptomes and epitopes by sequencing）。 虽然蛋白质表达数据和转录组数据同时测序能够解决仅测转录本所产生的局限性，但是会增加每个单细胞所需的测序读取深度，使得成本大幅上升。 并且，目前仍然缺乏分析工具来实现转录-蛋白数据集的联合分析。

研究目的：通过BD单细胞捕获平台，开发一种单细胞靶向转录组测序方法。

主要结果： 在单次实验中， 对20000个细胞的特定表面膜蛋白分子的表达和每个细胞中400多个基因的表达同时测序。与全转录组方法相比，这种针对性的方法仅需要测序深度的十分之一，而对低丰度转录本却保持了高灵敏度。

参考文献

Florian Mair et al., A Targeted Multi-omic Analysis Approach Measures Protein Expression and Low-Abundance Transcripts on the Single-Cell Level. Cell Rep. 2020 Apr 7;31(1):107499. doi: 10.1016/j.celrep.2020.03.063.